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SARS-CoV2 replication in airway epithelia, ALI culture, motile cilia [Wu et al., 2023, Cell 186, 112–130]_2 multiple core microvilli proteins : EZRIN. EBP50, SLK, actin(phalloidin) ALI culture에서 microvilli-like structures가 존재함. SARS-CoV2 감염시, 6시간에는 바이러스의 NP와 SP가 세포질에만 존재. 24시간부터 NP와 SP가 microvilli와 함께 국소화. 바이러스 입자가 motile cilia보다 microvilli에 축적됨을 보임. → 새로 만들어진 바이러스 입자가 microvilli에 축적됨. in vitro상에서 역시 SARS-CoV2가 microvilli와 상호작용하여, 호흡기 내에서 확산됨. SARS-CoV2 감염 후, Phosphorylated EZR levels이 증가하엿다. actin-bi.. 2023. 1. 6.
SARS-CoV2 replication in airway epithelia, ALI culture, motile cilia [Wu et al., 2023, Cell 186, 112–130]_1 Highlights SARS-CoV2는 감염 즉시 airway epithelia의 multicilia에 있는 ACE2에 결합. motile cilia를 depleting하면 SARS-CoV2와 다른 호흡기 바이러스의 entry를 억제할 수 있음. SARS-CoV2는 PAK Kinases를 활성화하여 바이러스 출구 구동하는 airway microvilli를 재배열. Omicron은 airway mucin barrier를 통한 cilia-dependent entry를 가속화. Impact & Novelty SARS-CoV2가 airway barrie를 관통하여 nasal epithelium 감염시키는 방법 명확하지 않음. motile cilia, microvilli, and mucociliary-depend.. 2023. 1. 4.
chimeric receptor, efferocytosis 논문 (Morioka et al., Cell, 202212) Highlights (Impact & Novelty) efferocytosis 향상시키기 위한 efferocytosis(CHEF)용 chimeric receptors 설계. CHEF 통한 efferocytosis 촉진은 in vivo에서 multuple inflammatory insults 약화. protein folding 과 misfolded protein degradation은 efferocytosis의 rate-limiting step임. CHEF expression은 진행중인 질병의 결과를 개선할 수 있음. introduction efferocytosis : 식세포에 의해 apoptotic cell이 제거되는 과정 → 조직의 항상성 유지에 필수적. efferocytosis이 망가져있으면 죽상동맥.. 2022. 12. 27.
DNA sequence (sanger sequence vs NGS) and DNA microarray DNA sequencing은 현재 바이오인포메틱스가 발달할 수 있었던 가장 큰 핵심 기술입니다. sequencing reaction의 주요 원리를 통해 우리는 이제 사람의 genome을 모두 알 수 있게 되었죠. 그럼 오늘은 이런 DNA sequencing 기술에 대해 이야기해보려합니다. DNA sequencing DNA seqeuncing은 우선 핵산 서열, 즉 DNA의 뉴클레오타이드의 순서를 결정하는 과정을 이야기합니다. DNA는 저번에 이야기 한 것과 같이 G.A.T.C로 이루어져있고 이들이 상보적으로 연결이 되어있는 구조이죠. 이러한 상보적으로 연결된다는 원리를 이용해서 DNA 서열을 알 수 있게 되었고, 2003년까지 human genome을 완성하는 project가 시행되었었죠. 오늘은 이런 .. 2022. 12. 22.
바이오인포메틱스를 이해하기위해 알아야하는 생물학 지식!!!_1 바이오인포메틱스는 컴퓨터를 활용하여 생명체에 대해 분석하고 연구하는 학문입니다. 그러다보니 이 바이오인포메틱스를 공부하고 이해하기위해서는 기본적인 생물학적 지식이 필요합니다. 오늘은 이렇게 기본적으로 필요한 생물학 지식을 몇가지 이야기해보려합니다. Cell : 세포 Cell은 모든 생물체의 기본적인 구성요소입니다. 많은 생물체들은 unicellular의 형태를 하고 있습니다. unicellular란, 하나의 세포로 구성되어져있지만 이 세포 하나만으로 하나의 생물체가 되는 것을 이야기합니다.하지만 일명 고등생물이라고 하는 우리가 알고있는 동물이나 식물과 같은 생물들은 수천, 수만개의 세포로 구성되어져 있습니다. Cell은 크게 2가지의 유형으로 나눌 수 있습니다. Prokarytic cell(원핵세포)과 .. 2022. 11. 7.
[약동학 Pharmacokinetics] 능동수송 active transport 능동수송이란 수동수송과 다르게 세포에서 농도 차이를 극복하여 물질을 수송하는 방식이다. 세포막을 경계로 하여 물질이 낮은 농도에서 높은 농도로 수송된다. 이와같은 능동수송은 ATP를 이용하는 경우가 대부분이다. 이런 화학에너지를 이용하는 경우를 "1차성 능동수송"이라 한다. 미토콘드리아 내막과 같이 다른 형태의 에너지를 이용하는 경우도 있다. 이러한 경우는 전기화학적 평형을 이요하는데, 이러한 경우를 "2차성 능동수송"이라 한다. 능동수송은 다음과 같은 특징이 있다. 농도구배(전기화학 포텐셜)에 역행하여 약물이 이행한다. 관여하고 있는 담체의 양에 한도가 있어 투과량이 약물농도에 비례해서 증가하는 것이 아니라, 투과량에 포화현상이 나타난다. 능동수송에는 구조특이성 이외에 부위특이성이 있다. 에너지를 필요.. 2022. 11. 3.
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